Daňová kontrola 2026: postup a vaše práva

Druhy kontrolních postupů

Finanční správa využívá několik typů prověřování:

• Postup k odstranění pochybností (POP) — neformálnější, kratší. Úřad žádá o doplnění nebo vysvětlení konkrétních údajů v přiznání.
• Místní šetření — fyzická návštěva úřadníka u plátce, zjišťování konkrétních skutečností. Bez formální kontroly.
• Daňová kontrola — nejformálnější forma. Komplexní prověření daňové povinnosti za vybrané období.
• Vyhledávací činnost — sběr informací bez zahájení formálního postupu (typicky kontroly v restauracích, službách).

Tento článek se zaměřuje primárně na daňovou kontrolu jako nejvážnější formu.

Zahájení kontroly

Kontrolu zahajuje finanční úřad protokolárně — sepisuje se Protokol o zahájení kontroly, který obsahuje:

• Datum a místo zahájení
• Předmět kontroly (které daně, jaká zdaňovací období)
• Rozsah kontroly
• Identifikaci kontrolovaného subjektu i kontrolního pracovníka

Kontrola se obvykle zahajuje na pracovišti finančního úřadu (předvolání) nebo u kontrolovaného subjektu (návštěva ÚFO). Při návštěvě úředník nese služební průkaz a Protokol.

Po zahájení běží lhůta — finanční úřad má 3 roky od konce roku, ve kterém vznikla povinnost přiznání, na vyměření doměrku (lhůta pro vyměření daně). Kontrola nesmí trvat déle než obvyklou dobu — pro středně složité kontroly cca 3–6 měsíců, pro složité případy až 12+ měsíců.

Vaše práva při kontrole

Daňový řád garantuje kontrolovanému subjektu řadu práv:

• Právo na informaci — předem znát, kdy a kde se kontrola koná, jaký je její předmět a kdo ji vede
• Právo na zastoupení — přizvat si daňového poradce, advokáta nebo účetní
• Právo nahlížet do spisu — všechny dokumenty, které finanční úřad shromáždil
• Právo navrhovat důkazy — můžete předkládat doklady, žádat o slyšení svědků, znalecké posudky
• Právo vyjádřit se — k veškerým zjištěním ÚFO před uzavřením kontroly
• Právo na řádné odůvodnění — kontrolní zpráva musí obsahovat zdůvodnění případných závěrů
• Právo odvolat se proti platebnímu výměru po skončení kontroly

Co finanční úřad obvykle prověřuje

Typické předměty kontroly:

• Příjmy — soulad mezi fakturami, výpisy z účtu, hotovostí a přiznáním. Hledá se zatajený příjem.
• Výdaje — daňová uznatelnost. Doklady, smlouvy, prokazatelný vztah k podnikatelské činnosti.
• DPH — odpočty na vstupu (zda jsou opravdu pro ekonomickou činnost), reverse charge, kontrolní hlášení vs přiznání
• Mzdy — výplaty, srážky, sociální/zdravotní odvody, časté skryté zaměstnání („švarcsystém")
• Obchody s rizikovými subjekty — nespolehlivými plátci, „prázdnými schránkami", offshore strukturami

Pro OSVČ s paušálem 60 % je kontrola obvykle jednodušší — vyžaduje jen evidenci příjmů, ne dokumentaci výdajů.

Jak se připravit

Před zahájením kontroly:

• Archivace — všechny doklady minimálně 3 roky (zákon o účetnictví do 10 let). Faktury, smlouvy, výpisy, daňová evidence.
• Konzultace s daňovým poradcem — i kdyby vás se vás přímo nedotýkala kontrola, projít přiznání s poradcem dopředu odhalí slabiny
• Procesní podklady — smlouvy se zaměstnanci, smlouvy se subdodavateli, smlouvy o pronájmu
• Důkazy o ekonomickém charakteru výdajů — zápisy z jednání, e-mailová komunikace, doklady o realizaci

Průběh kontroly

Po zahájení:

1. Předložení podkladů — daňový řád dává obvykle 8–15 dnů na předložení vyžádaných dokladů
2. Konzultace — úředník může klást otázky, žádat vysvětlení, doplnění
3. Případné svědecké výpovědi — pokud má ÚFO pochybnosti, může vyslýchat třetí osoby (zaměstnance, klienty, dodavatele)
4. Místní šetření — návštěva u kontrolovaného subjektu, prohlídka provozovny, inventarizace
5. Předběžné výsledky — úředník připravuje předběžnou kontrolní zprávu
6. Vaše vyjádření — máte právo se k závěrům vyjádřit, předložit dodatečné důkazy
7. Závěrečná zpráva — konečná verze s vyčíslením případného doměrku
8. Platební výměr — formální rozhodnutí s povinností úhrady

Doměrek a sankce

Pokud kontrola odhalí nesprávnosti:

• Doměrek daně = rozdíl mezi vyměřenou a původní daní
• Penále 20 % z doměrku (pokuta za nepřiznané daňové povinnosti) — § 251 daňového řádu
• Úrok z prodlení = repo sazba + 8 procentních bodů, od původního termínu splatnosti
• V závažných případech trestní oznámení pro zkrácení daně (zkrácení nad 100 000 Kč je trestný čin)

Penále 20 % lze snížit nebo prominout, pokud:

• Sami jste pochybení vyplnili dodatečným přiznáním před zahájením kontroly
• Šlo o ospravedlnitelný omyl
• Spolupracujete s úřadem a hradíte rychle

Odvolání proti rozhodnutí

Pokud nesouhlasíte s výsledkem kontroly, můžete:

• Vyjádřit se k závěrečné zprávě ještě před vydáním platebního výměru — neformální, ale účinné
• Podat odvolání proti platebnímu výměru ve lhůtě 30 dnů od doručení
• Pokud odvolání nevyhoví, podat správní žalobu u krajského soudu
• Případně kasační stížnost u Nejvyššího správního soudu

Pro hodnoty doměrku do 100 000 Kč obvykle nemá smysl jít cestou žaloby — náklady na právní zastoupení převýší případnou úsporu. Pro vyšší doměrky se odvolání i žaloba pravidelně vyplatí.

Praktická doporučení

• Při zahájení kontroly okamžitě kontaktujte daňového poradce — i jen pro konzultaci postupu.
• Předkládejte jen vyžádané dokumenty — nepředávejte spontánně další podklady, které finanční úřad nepožádal.
• Veďte si zápisník jednání s úředníkem — datum, místo, dotazy, vaše odpovědi.
• Při nestandardních výdajích (drahá technika, cestovné, marketing) připravte předem zdůvodnění ekonomického charakteru.
• Pro časté daňové kontroly v oboru (typicky pohostinství, řemeslné práce, hotovostní obchody) zvažte profesionální účetní s odpovědností za daňové podklady.
• Pamatujte na 30denní lhůtu na odvolání — zmeškání je definitivní, doměrek se stane vykonatelným.